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java 菌種16sRDNA測(cè)序,NCBI比對(duì)結(jié)果怎么分析?

菌種16sRDNA測(cè)序,NCBI比對(duì)結(jié)果怎么分析?首先,打開bioedit軟件,導(dǎo)入拼接樣本序列和標(biāo)準(zhǔn)子類型參考序列文件新對(duì)齊序列新序列導(dǎo)入拼接樣本序列和標(biāo)準(zhǔn)參考序列(使用文本文檔中的復(fù)制粘貼工具)應(yīng)

菌種16sRDNA測(cè)序,NCBI比對(duì)結(jié)果怎么分析?

首先,打開bioedit軟件,導(dǎo)入拼接樣本序列和標(biāo)準(zhǔn)子類型參考序列

文件新對(duì)齊序列新序列導(dǎo)入拼接樣本序列和標(biāo)準(zhǔn)參考序列(使用文本文檔中的復(fù)制粘貼工具)應(yīng)用并關(guān)閉以保存結(jié)果,關(guān)閉窗口

第二步,單擊菜單欄上的“附件應(yīng)用程序”按鈕,選擇[ClustalW multiple alignment

文件打開附件應(yīng)用程序ClustalW multiple alignment

第三步:對(duì)齊后,刪除對(duì)齊序列兩端的冗余序列,使所有序列長(zhǎng)度相等

選擇序列要編輯的序列編輯序列編輯序列并保存修改后的結(jié)果

第四:選擇“序列”菜單下的“間距”命令,單擊“鎖定間距”按鈕

第五:將對(duì)齊的序列另存為FASTA格式的文檔