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首先,序列的FASTA格式保存在進(jìn)化樹(shù)的TXT文本中,然后打開(kāi)Meggie 3.1。alignment Explorer/Clustal create a new alignment OK no for protein插入文件夾框的右上角。否是將數(shù)據(jù)保存到mega是在mega中打開(kāi)數(shù)據(jù)關(guān)閉系統(tǒng)發(fā)育鄰居連接樹(shù)的第二或第三間隔分支測(cè)試圖像另存為EMF格式

mega的全稱是分子進(jìn)化遺傳學(xué)分析。Mega可以用于序列比對(duì)、進(jìn)化樹(shù)的推斷、分子進(jìn)化速度的估計(jì)、進(jìn)化假設(shè)的驗(yàn)證等,還可以通過(guò)網(wǎng)絡(luò)(NCBI)進(jìn)行序列比對(duì)和數(shù)據(jù)搜索。打開(kāi)并選擇alignment—alignment Explorer/cluster,彈出對(duì)話框:按提示選擇。在這里,我將選擇第一個(gè)“創(chuàng)建新路線”。這里我將根據(jù)我的序列是核酸還是氨基酸來(lái)選擇。在這里我將選擇“是”,對(duì)話框?qū)⒊霈F(xiàn):日期打開(kāi)檢索序列從文件,選擇對(duì)齊格式文件[Clustal file(。AlN)]在cluster X中:選中后,可以雙擊文件名進(jìn)行修改(如果cluster X的某個(gè)版本不能識(shí)別原來(lái)的FASTA文件名,可以在這里進(jìn)行修改,就像cluster X 1.81的中文版本不能識(shí)別某些序列文件名一樣)。修改完文件名后,可以在右鍵菜單中單擊〖刪除簇〗按鈕,保存“當(dāng)前比較結(jié)果”供下次使用。然后,我將添加clusterx程序是集成的。在“對(duì)齊”菜單中,選擇“按簇X對(duì)齊”。選擇要對(duì)齊的序列,然后單擊以打開(kāi)以下對(duì)話框:選擇默認(rèn)設(shè)置,然后單擊“確定”以執(zhí)行對(duì)齊。之后,將出現(xiàn)一個(gè)轉(zhuǎn)換對(duì)話框,顯示兩兩對(duì)齊和多序列對(duì)齊的過(guò)程:等待它運(yùn)行后,您可以直接保存或刪除它。對(duì)話框?qū)⒊霈F(xiàn):選擇是,它將出現(xiàn):輸入一個(gè)名稱,如siv-n2,接下來(lái)的幾個(gè)步驟是類似的。保存后,單擊〖是〗按鈕,系統(tǒng)顯示:當(dāng)序列數(shù)據(jù)界面出現(xiàn)時(shí),注意的主界面發(fā)生了一定的變化,多了幾個(gè)功能菜單:在主界面中選擇系統(tǒng)發(fā)育菜單,系統(tǒng)發(fā)育的bootstrap檢驗(yàn)選擇相鄰連接1000個(gè)重復(fù)序列作為bootstrap,選擇核酸p距離作為模型。經(jīng)過(guò)計(jì)算,我們得到了系統(tǒng)結(jié)構(gòu)樹(shù),如下圖:由kousyouki

Mega進(jìn)化樹(shù)如何改變生物的學(xué)名

轉(zhuǎn)到PPT,取消組合,然后它會(huì)變成一個(gè)單位框,你可以修改字體。

修改后,將它們組合在一起并以TIF格式保存。決議應(yīng)該是可以的。