分子對接軟件 簡述分子對接的主要類型及其優(yōu)缺點?
分子對接是一種基于受體特性和受體與藥物分子相互作用的藥物設(shè)計方法。近年來,分子對接已成為計算機輔助藥物研究領(lǐng)域的一項重要技術(shù)。簡述分子對接的主要類型及其優(yōu)缺點?有很多方法。我將列出如下:1。dock程
分子對接是一種基于受體特性和受體與藥物分子相互作用的藥物設(shè)計方法。
近年來,分子對接已成為計算機輔助藥物研究領(lǐng)域的一項重要技術(shù)。
簡述分子對接的主要類型及其優(yōu)缺點?
有很多方法。我將列出如下:1。dock程序中有一個名為sdf2mol2的工具。一旦你聽了這個名字,你就會知道它將SDF文件轉(zhuǎn)換成mol2。但你需要通過dock官方網(wǎng)站申請dock項目。2Openbabel或Babel軟件非常容易使用,但是如果SDF是一個包含多個分子的文件,那么轉(zhuǎn)換就很麻煩。首先需要將多分子文件拆分為單個分子文件,即一個文件中只有一個分子,然后使用Babel進行轉(zhuǎn)換。當(dāng)然,您可以使用循環(huán)語句對其進行批處理轉(zhuǎn)換。以上兩種方法都可以通過免費工具實現(xiàn)。下一步,你可以把這種方法需要商業(yè)軟件的支持:3。Sybyl讀取Sybyl中的SDF文件,生成一個表,然后將表中的分子保存為mol2分子。4MOE
1:dock程序中有一個叫做sdf2mol2的工具。只要你聽了這個名字,你就會知道它是通過添加SDF文件轉(zhuǎn)換成mol2的。但是,您需要通過dock官方網(wǎng)站申請dock計劃。2:Openbabel軟件非常容易使用,但是如果SDF是一個包含多個分子的文件,那么轉(zhuǎn)換就很麻煩。首先需要將多分子文件拆分為單個分子文件,即一個文件中只有一個分子,然后用Babel進行轉(zhuǎn)換。當(dāng)然,可以使用循環(huán)語句對其進行批處理轉(zhuǎn)換。