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如何進行引物設計？

如果這對通用引物沒有信號，就意味著這兩個位置有SNP，導致沒有擴增。可以參考幾種方法。

1：你可能知道這種細菌的種類和屬，所以去NCBI找到相關種類的16S序列，做序列比對，設計簡并引物，擴增全長，然后測序。

2：你根本不了解物種。你可以在網(wǎng)上找到更多的入門知識。最好放大v3v4區(qū)或V4區(qū)。在放大了其中一些之后，你可以對它們進行排序和比較。一般來說，你可以確認屬，然后按照1的方法。

3:如果部分序列可以通過方法2擴增，但全長引物未能擴增，則將獲得的部分序列用作race。

4:以上所有操作均失敗。第二代的DNA被提取和測序，基因組被直接測量（如果你認為成本太高，你可以減少數(shù)據(jù)量進行比較）。