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數(shù)據(jù)分析基礎(chǔ) seq格式文件用什么軟件打開?

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.SEQ文件是DNA分析用的生物學軟件的數(shù)據(jù)文件。打開.SEQ文件,可以使用DNASTARLasergene或Viewwithatexteditor軟件打開。DNASTARLasergen是全面的生物醫(yī)學軟件,用作DNA和蛋白質(zhì)序列分析、重疊群拼接和基因工程管理。包含了7個模塊:SeqBuilder--可視化和序列編輯SeqManPro--序列集結(jié)和SNP發(fā)現(xiàn)MegAlign--序列組合PrimerSelect--oligoprimer設(shè)計Protean--蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和預測GeneQuest--基因查找EditSeq--導入特殊文件工具

做完了轉(zhuǎn)錄因子的chip-seq后選擇了感興趣的靶基因,接下來還要做傳統(tǒng)的chip qpcr驗證嗎?

轉(zhuǎn)錄因子的chip-seq不一定需要qpcr驗證,但如果對轉(zhuǎn)錄因子進行敲除或knockdown,又不愿意做chip-seq,可對靶基因進行chip-qpcr。做western如果是轉(zhuǎn)錄因子,作用位置應該在核內(nèi),但有一些TF是細胞質(zhì)易位到細胞核,所以看你關(guān)心的是總量還是什么,是否存在特殊修飾等等,根據(jù)需求選擇。