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本地blast使用教程 如何使用ncbi核苷酸blast?

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如何使用ncbi核苷酸blast?

選擇要比較的蛋白質(zhì)序列,在blast界面的enterquerysequence下的大框中輸入。如果要與數(shù)據(jù)庫中的所有蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比較,請(qǐng)從下面的“選擇”搜索集中選擇要比較的數(shù)據(jù)庫。程序選擇中的對(duì)齊方式可根據(jù)個(gè)人需要進(jìn)行選擇。如果執(zhí)行成對(duì)對(duì)齊或多個(gè)序列對(duì)齊,請(qǐng)?jiān)凇拜斎氩樵冃蛄小笨蛑羞x擇“對(duì)齊兩個(gè)或多個(gè)序列”,在彈出框中輸入要對(duì)齊的序列,然后單擊“blast”。結(jié)果評(píng)分越高,同源性越高。E值是期望值。分?jǐn)?shù)越低,同源性越高

引物爆炸。在線設(shè)計(jì)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)的特異性寡核苷酸引物。該工具集成了當(dāng)前流行的primer3和NCBI-blast,用于引物特異性驗(yàn)證。底漆噴砂避免了使用其他站點(diǎn)或工具設(shè)計(jì)底漆的步驟,設(shè)計(jì)的底漆程序直接與噴砂一起導(dǎo)入