解決PBS腳本運行bash報錯的方法
在最近幾天,我們的服務(wù)器進行了一次對bash漏洞的更新,將bash版本升級到了4.1.2。然而,在用戶通過PBS提交作業(yè)時,我們遇到了一個bash報錯的問題。具體的錯誤信息如下:-bash: BASH
在最近幾天,我們的服務(wù)器進行了一次對bash漏洞的更新,將bash版本升級到了4.1.2。然而,在用戶通過PBS提交作業(yè)時,我們遇到了一個bash報錯的問題。具體的錯誤信息如下:
-bash: BASH_FUNC_module(): line 0: syntax error near unexpected token `)'
-bash: BASH_FUNC_module(): line 0: `BASH_FUNC_module() () { eval `/usr/bin/modulecmd bash $*`}'
-bash: error importing function definition for `BASH_FUNC_module'
不同的機器可能會有不同的報錯信息,但出現(xiàn)這種情況的原因是因為針對ShellShock漏洞的BASH補丁在定義輸出函數(shù)的語法上與以前有所不同。正常情況下,我們定義一個函數(shù)并輸出,之前的方式是這樣的:
```shell
function_name() {
output
}
```
然而,由于更新后的BASH補丁,輸出函數(shù)的定義方式發(fā)生了變化,變成了這樣:
```shell
function_name() () {
output
}
```
這兩種方式并不兼容,導(dǎo)致了我們遇到的錯誤。
針對這個問題,我們可以采取一種通用的解決方法,即在作業(yè)腳本的最前面加上以下一行代碼:
```shell
source
```
這樣,我們就重新載入了模塊初始化腳本,避免了剛剛報錯的錯誤。這種方法適用于大多數(shù)PBS腳本的情況。
值得一提的是,在解決這個問題時,我們需要確保系統(tǒng)中已經(jīng)安裝了``文件,該文件通常位于`/etc/profile.d/`目錄下。如果系統(tǒng)中沒有該文件,我們可以嘗試使用以下命令安裝:
```shell
sudo apt-get install environment-modules
```
另外,我們還可以檢查一下是否有其他與模塊相關(guān)的環(huán)境變量發(fā)生了變化,比如`MODULESHOME`和`MODULEPATH`等。這些環(huán)境變量的路徑應(yīng)該正確指向模塊所在的位置。
綜上所述,通過在PBS腳本中重新載入模塊初始化腳本,我們可以解決由于bash更新導(dǎo)致的報錯問題。這樣,我們的PBS作業(yè)就能正常運行了。