如何使用ncbi核苷酸blast？選擇要比較的蛋白質(zhì)序列，在blast界面的enterquerysequence下的大框中輸入。如果要與數(shù)據(jù)庫中的所有蛋白質(zhì)序列進行比較，請從下面的“選擇”搜索集中選擇

如何使用ncbi核苷酸blast？

選擇要比較的蛋白質(zhì)序列，在blast界面的enterquerysequence下的大框中輸入。如果要與數(shù)據(jù)庫中的所有蛋白質(zhì)序列進行比較，請從下面的“選擇”搜索集中選擇要比較的數(shù)據(jù)庫。程序選擇中的對齊方式可根據(jù)個人需要進行選擇。如果執(zhí)行成對對齊或多個序列對齊，請在“輸入查詢序列”框中選擇“對齊兩個或多個序列”，在彈出框中輸入要對齊的序列，然后單擊“blast”。結(jié)果得分越高，同源性越高。E值是期望值。分?jǐn)?shù)越低，同源性越高

應(yīng)該有用。不清楚我所說的是否準(zhǔn)確。Blast是NCBI中序列搜索或?qū)R的功能。通過序列的爆破，我們可以發(fā)現(xiàn)我們的擴增片段與測序片段的一致性，從而推斷出我們擴增片段的具體功能。通過序列比對，我們還可以找到擴增片段的源生物體與其他生物體之間的遺傳關(guān)系

引物爆炸，在線設(shè)計特異性寡核苷酸引物進行聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）。該工具集成了當(dāng)前流行的primer3和NCBI-blast，用于引物特異性驗證。底漆噴砂避免了使用其他站點或工具設(shè)計底漆的步驟。設(shè)計的引物程序直接使用blast來選擇需要比較的蛋白質(zhì)序列。在blast界面的Enter query sequence下的大框中輸入。如果要與數(shù)據(jù)庫中的所有蛋白質(zhì)序列進行比較，請在下面的“選擇搜索集”中選擇需要比較的數(shù)據(jù)庫。程序選擇中的對齊方式可根據(jù)個人需要進行選擇。如果執(zhí)行成對對齊或多個序列對齊，請在“輸入查詢序列”框中選擇“再對齊兩個序列”，在彈出框中輸入要對齊的序列，然后單擊“blast”。結(jié)果得分越高，同源性越高。E值為期望值，分值越低，同源性越高